PDGFA在鼻咽癌中的差异表达及其功能分析
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1.右江民族医学院;2.右江民族医学院附属医院

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2018年右江民族医学院校级科研课题(yy2018ky015)


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    摘要:目的 探讨血小板衍生生长因子A(platelet-derived growth factor A,PDGFA)在鼻咽癌中的差异表达和可能的功能作用。方法 利用基因芯片数据库(GEO数据库)中的基因表达谱数据,通过GEO2R在线分析工具分析PDGFA基因在正常鼻炎黏膜组织与鼻咽癌组织中的差异表达情况,并通过STRING数据库和DAVID数据库分析该基因及其相关基因的功能作用,最后通过GCBI在线实验室分析其可能参与的共表达调控网络,并预测其转录调控因子。结果 发现PDGFA基因在正常与鼻咽癌组织中具有差异表达。PDGFA基因及其相关基因功能富集分析发现,它们共同参与了12个BP、4个CC、3个MF和11个KEGG,并在肿瘤的发生、发展和转移过程中均具有显著的富集作用,如MAPK信号通路、Jak-STAT信号通路、细胞增殖的正调控、细胞迁移的正调控、粘着、ERK1和ERK2级联的正调节、蛋白质自磷酸化的正调控等。另基因共表达调控网络和转录因子预测发现,PDGFA基因与许多基因、蛋白、转录因子以及microRNA具有相互作用。结论 PDGFA可能通过多种途径,如细胞增殖和迁移的正调控、信号转导、蛋白质自磷酸化以及分子间的相互作用等参与鼻咽癌的发生、发展和迁移。

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  • 收稿日期:2020-06-03
  • 最后修改日期:2020-07-18
  • 录用日期:2020-08-05
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