环状RNA hsa_circ_0003568通过miR-140-3p及miR-502-5p调控靶基因CDK6及 NFYA在骨肉瘤中的作用
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广西医科大学

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广西自然科学基金项目(2019GXNSFAA185004)


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    目的 本研究旨在探讨环状RNA hsa_circ_0003568骨肉瘤中的表达并采用生物信息学方法进行circRNA-miRNA-mRNA的网络构建,分析其可能的机制及临床意义。方法 采用实时定量聚合酶链反应(RT-PCR)检测hsa_circ_0003568在骨肉瘤细胞系及正常成骨细胞中的表达。随后,基于circRNA-miRNA对和miRNA-mRNA构建ceRNA网络。通过多种circRNA软件数据库进行分析hsa_circ_0003568靶向的miRNA,并进一步通过miRNA数据软件预测其靶基因,选择至少4个以上软件支持的靶向miRNA及靶基因,并通过GEPIA数据库软件对靶基因进行生存分析筛选出显著预后差异的靶基因从而分析hsa_circ_0003568潜在的临床意义。结果 实时荧光定量 PCR 检测结果表明:与正常对照组相比,hsa_circ_0003568在骨肉瘤细胞系中显著升高(p<0.05)。测序发现hsa_circ_0003568的成环连接点位于IST1前体RNA的第5和6外显子上。生物信息学分析结果显示:hsa_circ_0003568同时靶向两个miRNA(miR-140-3p及miR-502-5p),构建了hsa_circ_0003568、miR-140-3p/miR-502-5p及13个靶基因的circRNA-miRNA-mRNA网络,此外,GEPIA数据库分析中发现的两个靶基因,CDK6和NFYA,与骨肉瘤的生存预后显著相关(p<0.05),并且NFYA基因同时是miR-140-3p及miR-502-5p的潜在靶基因。结论 高表达的hsa_circ_0003568可能通过miR-140-3p及miR-502-5p调控CDK6及NFYA基因参与骨肉瘤发生发展过程中生物学行为。

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  • 收稿日期:2020-07-04
  • 最后修改日期:2020-08-16
  • 录用日期:2020-08-17
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