PPARGC1A通过影响肿瘤微环境中免疫成分改善肾透明细胞癌的预后
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皖南医学院弋矶山医院

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安徽省中央指导地方科技发展专项项目;皖南医学院重点研究项目培育基金


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    摘要:目的 通过分析肿瘤微环境(TME),确定与肾透明细胞癌(KIRC)关键基因相关的肿瘤浸润免疫细胞(TICs)的组成,揭示关键基因的独立预后价值。方法 应用CIBERSORT和ESTIMATE计算方法,从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中计算了611例KIRC患者免疫和基质成分的数量和TICs的比例。通过对差异表达基因(DEG)进行了分析并进行Cox回归分析和构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)。然后,通过单因素COX与PPI的交集分析,确定过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活因子-1A(PPARGC1A)为预后因子。进一步对PPARGC1A的表达进行差异分析、生存分析、临床相关性分析、基因集富集分析(GSEA)、TICs组成比例及相关性分析。结果 PPARGC1A的表达与临床病理特征(临床分期、远处转移)呈负相关,与KIRC患者的生存呈正相关。基因集富集分析(GSEA)显示,高表达PPARGC1A组的基因主要富集于代谢途径和免疫相关活性。对TICs比例的CIBERSORT分析表明,幼稚B细胞,巨噬细胞M2与PPARGC1A表达呈正相关,但调节性T细胞(Treg)和T细胞滤泡辅助因子(Tfh)与PPARGC1A表达呈负相关,提示PPARGC1A可能负责调控TME的免疫成分。结论 PPARGC1A的表达水平可能有助于改善KIRC患者的预后,特别可能通过影响TME的免疫成分发挥作用,同时也揭示了PPARGC1A作为免疫治疗发展的潜在靶点和生物标志物。

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  • 收稿日期:2020-07-19
  • 最后修改日期:2020-08-31
  • 录用日期:2020-09-16
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