基于生信分析ANKRD26在肝细胞癌中的表达、预后及与化学物质的相互作用
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R735.7

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    目的 通过数据挖掘剖析锚蛋白重复结构域蛋白26(Ankyrinrepeatdomain-containingprotein26,ANKRD26)在肝细胞癌组织中表达情况,分析其表达差异与患者生存预后之间的关系;同时探索与其有相互作用的蛋白及化学物质。方法 从TCGA 数据库下载33 种肿瘤的转录组数据和肝癌的临床资料。利用Perl语言整理数据和提取ANKRD26 mRNA在33种肿瘤的表达量;利用比例风险回归模型(Cox模型)进行单因素与多因素分析,并结合临床指标N值计算风险分数,且依据风险分数中值将肝癌病例分为低风险组与高风险组作生存曲线和ROC曲线;利用HumanProteinAtlas(HPA)数据库分析ANKRD26蛋白在肝细胞癌组织中的表达情况;同时,使用蛋白互作网络数据库(String数据库)构建与ANKRD26蛋白相互作用的蛋白网络;CTD数据库分析与ANKRD26相互作用的化学物质。结果 ANKRD26在肝癌等多种肿瘤中均有表达,与正常组织相比较,ANKRD26在肝癌组织中呈高表达(P <0.05);单因素与多因素独立预后分析均表明ANKRD26是独立的预后因子;根据Cox模型构建的风险公式,生存分析显示高风 险组与低风险组的生存时间差异有统计学意义(P <0.05);ROC曲线显示1、3、5年的AUC值分别为0.732、0.736、0.727;与ANKRD26相互作用的蛋白有UBAP1、MASTL、GAS7、ETV6、SRP72、SBDS、SMC等,可能参与人体造血、蛋白降解及信号传导等细胞功能。免疫组织化学检测结果显示,ANKRD26蛋白主要定位于细胞质,且在肝细胞癌组织中的表达量高于正常肝组织中的表达。有明确文献支持的与ANKRD26有相互作用的化学物质共有26种,其中7种起到促进ANKRD26的表达,另19种化学物质抑制ANKRD26的表达。结论 ANKRD26在肝细胞癌组织中呈高表达,ANKRD26是独立的预后因子,多种化学物质可能会影响其表达水平。

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