基于Notch通路相关基因结肠癌预后模型的构建及验证
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皖南医学院病理教研室

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安徽省卫生健康委科研项目(AHWJ2021b059);国家级大学生创新创业训练项目(202110368030)、(202110368068);活性生物大分子研究安徽省重点实验室自主研究课题(LAB202005)


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    目的 构建一个基于Notch通路相关基因的结肠癌预后模型并通过列线图绘制进行验证。方法:本研究从癌症基因组图谱(TCGA)中下载结肠腺癌患者的mRNA表达数据及相应的临床数据,从GEO数据库中收集验证队列GSE29632、GSE17537。采用基因集合富集分析(GSEA)鉴定差异表达基因。采用单因素和多变量Cox回归分析的方法构建了TCGA队列中的多基因预后标签,进一步建立了与Notch通路相关的预后风险模型,并通过生存分析和列线图评估其预后和预测价值。并通过C、index、ROC曲线和校准曲线等验证与结肠腺癌患者总生存期高度相关的列线图。结果:利用单变量Cox回归分析筛选出14个结肠腺癌预后相关Notch通路基因,进一步多变量Cox回归分析构建出包含5个Notch通路相关基因(CDHR2, KRT8P12, NEURL1B, SELE, FSTL3)的预后评分模型。ROC曲线和生存分析显示,高Notch通路相关基因风险评分与较差的生存结果显著相关(AUC=0.748,P<0.05)。Notch通路相关的基因特征被证明是一个独立的预后因素。构建了具有临床病理特征和Notch通路相关基因特征的列线图,进一步预测结肠腺癌患者的预后,在C-index、ROC曲线和校准曲线上也表现良好(C-index=0.794,AUC=0.785)。结论:构建的包含5个Notch信号通路相关基因的结肠腺癌预后模型具有良好的预后预测效果,可有望作为评估结肠腺癌患者预后的指标。

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  • 收稿日期:2021-12-13
  • 最后修改日期:2021-12-29
  • 录用日期:2022-01-18
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