基于ceRNA调控网络的乳腺癌预后相关生物标志物筛选
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R737.9

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    目的 利用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库筛选差异表达mRNA、miRNA和lncRNA分子标签,构建预后相关 的核心ceRNA调控子网络,探索其在乳腺癌预后相关生物标志物筛选中的作用。方法 从TCGA 下载乳腺癌患者的测序数据和临床数据,利用R包“Deseq2”和单因素COX 比例风险回归模型,分别筛选差异表达且与预后相关的mRNA、miRNA和lncRNA分子标签,基于预测性数据库构建ceRNA 网络,并对网络中的核心mRNA 进行功能注释和免疫相关性分析。结果 筛选出3个mRNA(KLF11、EDA、STXBP1)、1个lncRNA(XIST)和2个miRNA(hsa-miR-130a-3p、hsa-miR-195-5p)组成的核心ceRNA子网络,生存分析显示miRNA 低表达、mRNA 和lncRNA 高表达,总生存期显著降低。结论 核心ceRNA子网络中的6个RNA相互调节,可能通过免疫系统在乳腺癌发生发展中起重要作用,对预后产生影响。

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