基于生物信息学分析RNF111基因在肾透明细胞癌中的表达及临床意义
DOI:
CSTR:
作者:
作者单位:

右江民族医学院

作者简介:

通讯作者:

中图分类号:

基金项目:

国家自然科学(31860313、82160502);广西自然科学(2019JJA140432);广西研究生教育创新计划项目(JGY2019166);广西学术学位硕士研究生创新课题(YCSW2022464)


Author:
Affiliation:

Fund Project:

  • 摘要
  • |
  • 图/表
  • |
  • 访问统计
  • |
  • 参考文献
  • |
  • 相似文献
  • |
  • 引证文献
  • |
  • 资源附件
  • |
  • 文章评论
    摘要:

    目的:通过在线数据库挖掘分析RNF111基因在肾透明细胞癌(KIRC)患者组织中的表达、临床意义和生物学功能。方法:应用GEPIA、TIMER、UALCAN、HPA、LinkedOmics和DAVID等在线生物信息学工具分析TCGA数据库中RNF111基因在KIRC组织和癌旁组织中表达水平及与患者预后的关系,并对相关蛋白功能和KEGG信号通路进行富集;应用GeneMANIA数据库构建RNF111蛋白-蛋白相互作用网络。结果:RNF111在KIRC组织中表达水平显著低于正常肾组织;RNF111在KIRC患者不同病理分期和分级中存在表达差异,且随着病理分期和分级的升高,表达水平有下调趋势;RNF111在不同种族中存在表达差异,亚裔人群表达显著高于其他种族人群。生存分析表明,RNF111的表达水平与KIRC患者的总体生存率与无病生存率显著相关,RNF111高表达组患者总体生存率和无病生存率明显高于RNF111低表达组患者。GO生物学富集分析结果表明,RNF111与RNA聚合酶II启动子的转录延伸、蛋白酶体介导的泛素依赖性蛋白质分解代谢过程及蛋白质多聚泛素化等生物过程有关。KEGG分析结果显示,RNF111表达相关基因与胞吞作用、肾细胞癌及泛素介导的蛋白水解等信号通路相关。结论:在KIRC中RNF111的表达与患者的病理分期与分期及预后有相关性,因此RNF111可能成为KIRC的预后标志物及潜在治疗靶点。

    Abstract:

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文
相关视频

分享
文章指标
  • 点击次数:
  • 下载次数:
  • HTML阅读次数:
  • 引用次数:
历史
  • 收稿日期:2022-04-13
  • 最后修改日期:2022-05-24
  • 录用日期:2022-05-25
  • 在线发布日期:
  • 出版日期:
文章二维码