转录组测序分析急、慢性乙型肝炎患者外周血单个核细胞基因变化
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右江民族医学院附属医院

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    目的:筛选急性乙型肝炎(acute hepatitis B,AHB)和慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)外周血单个核细胞中异常表达基因。方法:收集在我院就诊的3例AHB与3例CHB外周血,分离单个核细胞,提取RNA后进行转录组测序,根据p<0.05且|log2FC|>1计算两组样本的表达差异,绘制差异基因热图。对差异基因进行GO功能与KEGG信号通路聚类。结果:AHB组和CHB组两组间满足p<0.05且|log2FC|>1差异条件的基因共计725个,其中上调372个,下调353个。差异基因主要富集的GO功能:微管发生功能、内源性刺激反应功能、组织发生功能、细胞增殖调控功能与细胞增殖功能和细胞外区域功能。差异基因主要富集的KEGG信号通路:PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、硫胺素代谢通路、癌症转录失调和IL-17信号通路。结论:我们的结果提供了AHB和CHB外周血单个核细胞中差异表达基因变化的一般情况与可能调控功能与通路,可能有助于阐明AHB和CHB的发展机制。

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  • 收稿日期:2022-07-20
  • 最后修改日期:2022-08-02
  • 录用日期:2022-08-25
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