铜死亡相关性lncRNA在甲状腺癌中的表达模式以及预后价值
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右江民族医学院

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2019JJB140028


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    目的 探索与铜死亡相关的lncRNA在甲状腺癌(thyroid carcinoma,THCA)中的表达模式及预后价值。方法 基于TCGA数据集,通过共表达获得相关的lncRNA。将THCA患者随机分成训练集和验证集,基于Cox和Lasso回归分析确定预后关键基因,采用验证集和整个列队对独立预后基因进行验证,同时通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)验证关键基因在THCA中的表达情况。最后对风险模型进行富集分析、肿瘤微环境分析、免疫相关性分析以及药物敏感性分析。结果 12个铜死亡基因通过共表达获得1270个相关的lncRNA。在16个与铜死亡预后相关的基因中,TMEM220-AS1、LINC01711和AC003086.1被确定为关键基因。风险评分(Risk Score)在训练集和整个列队中均展示出良好的预测性能,并且qPCR结果与生信结果一致。高低风险组的患者在生物学功能、免疫细胞浸润程度以及免疫检查点均存在明显的不同。此外,风险评分与THCA的药物敏感性显著相关。结论 我们构建的预后风险模型在预测THCA患者的生存和指导免疫治疗药物的使用方面具有很大潜力。

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  • 收稿日期:2022-12-05
  • 最后修改日期:2022-12-09
  • 录用日期:2023-03-06
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