基于全转录组测序的小鼠HCC中miR1225p和miR27b3p调控Top2a异常表达的机制分析
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R735.7

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    目的 基于全转录组测序探讨小鼠肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)组织中miR-122-5p和miR-27b-3p 调控DNA拓扑异构酶2-a(DNAtopoisomerase2-alpha,Top2a)异常表达的可能调控机制。方法 通过构建小鼠HCC 模型、实时荧光定量PCR(RT-qPCR)和全转录组测序等生物信息学手段,以及结合TheHumanProteinAtlas(人类蛋白 质图谱数据库),分析Top2a 在瘤体组织和正常肝组织中的差异表达,并进一步筛选与Top2a 或其编码蛋白有PPI和靶 标关系的差异(q <0.05,q 为校正的P )表达基因和miRNA,分析其功能。构建Top2a 编码蛋白的蛋白质-蛋白质互 作图(PPI)和分析Top2a 及相关基因参与的生物学功能。结果 与对照组相比,瘤体组织中Top2a 差异过表达(P < 0.05),且存在87个与Top2a 编码蛋白互作、差异表达的蛋白编码基因。GO 功能富集显示,Top2a 及相关基因主要存 在于细胞核,且多数具有蛋白结合和DNA结合活性,参与RNA 聚合酶Ⅱ启动子转录的正向调节、细胞对DNA 损伤刺 激的反应和染色体分离等生物学过程。同时,存在miR-27b-3p和miR-122-5p这2种靶向于Top2a 的miRNA在瘤体组 织中表达显著低于对照组织。Top2a 基因在肝癌组织中RNA和蛋白质表达水平均高于正常肝组织,此外,Top2a 基因 低表达的肝癌患者的生存率明显高于高表达的患者。结论 Top2a 基因在HCC中过表达是其细胞抑制了miR-122-5p 和miR-27b-3p表达的结果。而Top2a 在细胞核内通过蛋白结合和DNA结合等活性,影响转录起始、DNA 损伤刺激反 应和染色体分离等生物学过程,则是其在HCC中发挥作用的分子机制。Top2a 基因可能是预测肝癌预后的重要生物标 志物,有一定的临床诊断价值。

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