IGKC在泛癌中的差异表达及其相关临床特性分析
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广西百色市右江民族医学院

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国家自然科学基金项目(面上项目,重点项目,重大项目),广西自然基金项目,广西学生资助研究专项立项课题


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    摘 要:目的 通过生物信息学方法了解肿瘤来源的IGKC功能,并从临床角度认识IGKC在肿瘤发生发展中所扮演的角色。方法 使用UCSC、TCGA、GTEx、GEPIA2等数据库从基因表达、基因变异、预后分析、肿瘤干性、免疫细胞浸润、富集分析等角度对不同肿瘤中的IGKC进行全面分析。结果 大多数癌组织的IGKC表达水平显著高于正常组织,IGKC表达水平显著升高与部分肿瘤预后、干性、基因变异和免疫细胞浸润显著相关。IGKC相互作用基因和相关基因参与了T细胞受体信号通路、癌症中PD-L1表达和PD-1检查点通路和Th1、Th2和Th17细胞分化通路等多种信号通路。另外,这些基因也参与了免疫应答、结合U1/2/6 snRNP和结合T细胞受体等多种生物过程。结论 IGKC在多种癌中高表达,在多种癌的4个病理阶段具有显著差异,与患者预后之间存在相关性,IGKC有望成为多种肿瘤新型生物标志物。

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  • 收稿日期:2023-04-13
  • 最后修改日期:2023-05-21
  • 录用日期:2023-05-29
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