头颈部鳞状细胞癌血管生成预后模型的构建及验证
DOI:
CSTR:
作者:
作者单位:

作者简介:

通讯作者:

中图分类号:

R730.26

基金项目:


Author:
Affiliation:

Fund Project:

  • 摘要
  • |
  • 图/表
  • |
  • 访问统计
  • |
  • 参考文献
  • |
  • 相似文献
  • |
  • 引证文献
  • |
  • 资源附件
  • |
  • 文章评论
    摘要:

    目的 通过生物信息学的方法构建头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)血管生成相关基因(angiogenesisrelatedgenes, ARGs)预后模型,验证模型的预测价值。方法 从UCSCXena数据库下载头颈部鳞状细胞癌(TCGA-HNSCC)数据集, 获取差异表达的ARGs,通过单因素Cox回归分析、蛋白互作网络(PPI)筛选预后相关核心ARGs,利用LASSO 回归分 析构建预后模型,分析高低风险组的预测效能,并使用GSE41613数据集进行验证。利用ESTIMATE算法对高低风险 组进行免疫浸润分析,分析高低风险组免疫检查点基因表达的差异。对高低风险组进行药物敏感性分析。RT-qPCR验 证PLAU、VEGF-C 两个预后基因在舌鳞状细胞癌的表达情况。结果 在TCGA-HNSCC中获得了414个差异表达的 ARGs,基于14个ARGs构建了HNSCC预后模型。Kaplan-Meier生存曲线显示高风险组的生存时间低于低风险组(P <0.001),ROC曲线显示其有较高的预测价值(1年、3年、5年的AUC值分别为0.675、0.688、0.644),其预后价值在 GSE41613数据集得到了验证。免疫浸润分析提示低风险组具有更高的免疫浸润评分,低风险组高表达免疫检查点基 因。药物敏感性分析表明高低风险组对包括顺铂(cisplatin)、Tozasertib在内的多种药物的敏感性存在差异(P < 0.05)。RT-qPCR结果显示PLAU、VEGF-C 高表达于舌鳞状细胞癌(P <0.05)。结论 由14 个ARGs组成的 HNSCC风险评分模型,可有效预测HNSCC患者的预后及对药物治疗的反应。

    Abstract:

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文
相关视频

分享
文章指标
  • 点击次数:
  • 下载次数:
  • HTML阅读次数:
  • 引用次数:
历史
  • 收稿日期:
  • 最后修改日期:
  • 录用日期:
  • 在线发布日期: 2023-10-26
  • 出版日期:
文章二维码