基于孟德尔随机化探究炎症性肠病和非黑色素瘤皮肤癌的关系及筛选关键基因
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1.皖南医学院;2.皖南医学院病理教研室

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安徽省高校自然科学重点项目(2022AH051235);皖南医学院2023年度大学生科研资助金项目(WK2023XS05);国家级大学生创新创业训练计划项目(202310368004)


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    目的 采用孟德尔随机化方法研究炎症性肠病和非黑色素瘤皮肤癌发病风险的关系,并筛选关键基因。方法:从GWAS数据库获取炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)及其亚型克罗恩病(Crohn's?disease,?CD)和溃疡性结肠炎(Ulcerative colitis,UC)和非黑色素瘤皮肤癌(non-melanoma skin cancer,NMSC)的数据。本文的主要分析方法为逆方差加权法,利用Cochran’s Q检验异质性, MR-Egger-intercept检验是否存在水平多效性。依据指南筛选相关药物,从DrugBank与DGIdb数据库查找出4个药物靶点,进行eQTL的MR分析与共定位分析。结果 MR分析的结果表明,IBD(P:0.009, 95%CI:1.001~1.005,OR:1.003)及UC(P:0.003,95%CI:1.001~1.005,OR:1.003)是NMSC的危险因素,CD(P:0.071,95%CI:1.000~1.003,OR:1.002)与IBD没有因果关系。筛选出三个靶基因PTCH1、RXRB、SUFU与非黑色素瘤皮肤癌有因果关系,其中PTCH1和SUFU与炎症性肠病具有因果关系。结论 IBD、UC与NMSC发病风险有因果关联,CD与NMSC无因果关联。PTCH1和SUFU在两个疾病中有一定的因果关系,为IBD防治提供一定的参考价值。

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  • 收稿日期:2024-02-03
  • 最后修改日期:2024-02-26
  • 录用日期:2024-03-06
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