基于外泌体exoRBase2.0数据库构建肝细胞癌相关的ceRNA网络并进行相关分析
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R735.7

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    目的 基于生物大数据构建肝细胞癌(HCC)患者血液外泌体竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,并对HCC发 病机制进行探究。方法 从exoRBase2.0数据库中下载HCC患者和正常人群血液外泌体基因测序数据,并应用R语 言进行差异分析。通过TargetScan、miRanda、starBase和miRcode数据库预测与mRNA、lncRNA、circRNA 结合的 miRNA并对其进行差异表达分析,将结果导入Cytoscape软件,构建ceRNA 网络,进一步对其进行GO 和KEGG 富集 分析,并使用CytoHubba插件筛选核心基因。将核心基因导入UALCAN和Kaplan-MeierPlotter网站进行基因表达量 和生存分析;并通过TIMER2.0网站进行免疫浸润分析。结果 GO 分析显示富集在骨髓细胞分化和横纹肌细胞分化 等功能,KEGG分析显示富集在催产素信号通路和cGMP-PKG信号通路,生存分析显示CELF2高表达组HCC患者的 生存率显著高于低表达组;免疫浸润分析显示CELF2的高表达与HCC患者的肿瘤纯度显著呈负相关,与多种免疫细 胞显著呈正相关。结论 本研究成功构建了HCC患者血液外泌体ceRNA 调控网络,从分子层面阐述了HCC的发生、 转移和侵袭机制,为HCC的临床诊疗提供理论支持。

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