胃癌中铜死亡相关预后模型的构建及验证
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右江民族医学院

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R73

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右江民族医学院高层次引进人才项目经费(编号:YY2021sk02);2021年广西教育科学规划课题专项 (2021ZJY1536 ):医学本科生科研团队创新建设研究;国家级大学生创新创业训练计划项目(No.202210599007);作者单位:1. 533000 右江民族医学院基础医学院;2. 530000 广西大学医学院; 通信作者:蒋利和(1976-),男,博士,研究员,教授;主要从事肿瘤生物学研究,E-mail:Jianglihe@ymun.edu.cn;S


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    目的 综合运用生物信息学方法进行胃癌铜死亡相关预后模型的构建。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载胃癌患者mRNA表达数据和临床信息。利用R语言进行免疫浸润分析、WGCNA分析、Cox回归以及Lasso回归构建预后模型,并探究模型基因的差异表达情况。通过受试者特征曲线(ROC)曲线、生存分析、C-index曲线、独立预后分析,分析预后模型的预后价值。对高、低风险组进行免疫功能分析、GSEA富集分析,分析预后模型的潜在功能。结果 共得到139个与初始B细胞相关的铜死亡共表达基因。通过Cox回归和Lasso回归,筛选出6个预后相关的基因(DSE、GASK1B、GCSH、PLXNC1、PAMP2、TLR7)进行预后模型的构建。预后模型在胃癌患者的1、3、5年的预后情况中具有较高的预测价值。高风险组在胃癌患者中显示出较差的总生存期。C-index曲线、独立预后分析均显示预后模型具有较好的预后预测价值及独立的预测价值。并且高风险组在多个免疫功能中与低风险组均存在显著差异。结论 筛选出的6个初始B细胞相关的铜死亡共表达基因,以其构建的胃癌预后模型具有良好的预后预测价值。

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  • 收稿日期:2024-03-05
  • 最后修改日期:2024-03-13
  • 录用日期:2024-03-15
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