基于单细胞测序初步探索KRT19与胃癌患者良性预后的关联性研究
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1.右江民族医学院;2.右江民族医学院基础医学院

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    摘 要:目的 通过单细胞测序技术为主导的生信技术初步探索KRT19作为胃腺癌(STAD)发展和预后诊断生物标志物的价值。 方法 应用TCGA数据库下载STAD数据集分析基因的差异表达、ROC分析、免疫浸润分析、GSEA富集分析、药物敏感分析;收集GEO数据库收集的胃癌样本和胃正常组织样本的单细胞测序数据进行去批次、标准化、降维、聚类、注释、拟时序分析、infercnv恶性预测分析及CellChat分析;利用绘图网站jvenn绘制韦恩图;使用KM plotter网站对KRT19等基因进行KM生存曲线的绘制;使用string网站对KRT19基因进行蛋白质互作分析。 结果 KRT19在STAD组织高表达(P<0.001),尤其是在STAD组织上皮细胞高表达;KRT19高表达与STAD患者预后良好有关(P<0.05);KRT19高表达的上皮细胞在STAD分化末期出现。KRT19主要通过MDK(MK)信号通路影响STAD上皮细胞之间的相互作用;KRT19高表达的上皮细胞是良性上皮细胞;KRT19表达与中性粒细胞、浆细胞浸润成正相关,与CD8+T细胞浸润成负相关;KRT19与KRT18、AFP等基因存在相互作用;KRT19在角化、核糖体小亚基生物基因等通路发挥作用;高表达的KRT19对5-氟尿嘧啶、乙二醇等药物的药物敏感性较低表达的高。 结论 KRT19可能在分化末期的胃癌上皮细胞高表达,促进胃组织中的良性上皮细胞出现或增殖,对胃癌的发展具有良好预后的作用。

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  • 收稿日期:2024-03-14
  • 最后修改日期:2024-03-30
  • 录用日期:2024-04-03
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