目的：采用网络药理学方法结合临床回顾性分析，探讨扶正逐瘀汤治疗脓毒症合并多重耐药菌感染菌血症的作用机制。方法：回顾性队列研究方法分析2019年1月-2022年12月广西中医药大学第一附属医院仙葫院区重症医学科（ICU）的68例明确诊断脓毒症菌血症患者，并且药敏试验为多重耐药菌，根据是否使用扶正逐瘀汤分为观察组和对照组，观察组为菌血症多重耐药菌感染并使用扶正逐瘀汤的患者，对照组为菌血症多重耐药菌感染未使用扶正逐瘀汤的患者。所有的患者均进行了常规治疗。纳入标准：治疗前两组的序贯器官衰竭（SOFA）评分、急性生理与慢性健康评分（APACHE II评分）、中医症候评分、白细胞（WBC）计数、C 反应蛋白（CRP）水平差异无统计学意义（P>0.05）；比较治疗后两组的SOFA评分、APACHEⅡ评分、WBC计数、CRP水平、中医症候评分、症候疗效判定。利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、Uniprot数据库检索扶正逐瘀汤的主要活性成分和作用靶点，利用OMIM 和GeneCards 数据库分别检索脓毒症的靶点、菌血症的靶点、多重耐药菌的靶点，绘制韦恩图。使用Cytoscape3.10.1 软件、STRING 数据库、DAVID 数据库构建蛋白相互作用网络、基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果：治疗后两组SOFA评分、APACHEⅡ评分明显降低，且观察组明显优于对照组，差异具有统计学意义（P<0.05），观察组WBC计数、CRP水平、中医症候评分、症候疗效判定明显优于对照组，且差异具有统计学意义（P<0.05）。结论：在治疗脓毒症菌血症多重耐药菌感染患者治疗中，加用扶正逐瘀汤的临床治疗效果明显优于常规治疗，且扶正逐瘀汤可以通过多组分、多靶点抑制常见多重耐药菌，值得推广应用。