靶向高通量测序快速检测临床标本结核分枝杆菌及其耐药性中的应用
DOI:
CSTR:
作者:
作者单位:

广西壮族自治区胸科医院

作者简介:

通讯作者:

中图分类号:

基金项目:


Author:
Affiliation:

Fund Project:

  • 摘要
  • |
  • 图/表
  • |
  • 访问统计
  • |
  • 参考文献
  • |
  • 相似文献
  • |
  • 引证文献
  • |
  • 资源附件
  • |
  • 文章评论
    摘要:

    【摘要】目的: 评价运用靶向高通量测序(tNGS)检测临床标本结核分枝杆菌及其耐药性的价值。 方法: 回顾性分析2022年1月1日至2023年12月31日在广西胸科医院收治的疑似耐药肺结核病患者的痰样本或气管肺泡灌洗液样本213例进行tNGS,并将结果与传统培养及表型药物敏感性试验(DST)、快速分子技术进行比较,以表型DST为标准,进一步分析tNGS对抗结核药物耐药性的敏感度、特异度、准确度、Kappa值、曲线下面积(AUG)值。 结果:213例临床标本(痰液、BAL)传统培养结核分枝杆菌检出率为64.32%(137/213),tNGS法结核分枝杆菌检出率为96.24%(205/213),快速分子方法结核分枝杆菌检出率为74.18%(158/213),tNGS法检测MTB的阳性检出率最高,明显高于快速分子方法(X2=41.149,P<0.001)和传统培养(X2=68.568,P<0.001)。与137例有表型药敏结果比较,表型药敏试验与tNGS对利福平、异烟肼、链霉素、乙胺丁醇、氟喹诺酮类、对氨基水杨酸、卡那霉素、卷曲霉素的耐药检出率分别为90.51%(124/137)和87.59%(120/137)、69.34%(95/137)和61.31%(84/137)、38.69%(53/137)和29.20%(40/137)、34.31%(47/137)和31.39%(43/137)、21.17%(29/137)和19.71%(27/137)、0.72%(1/137)和0、4.38%(6/137)和2.19%(3/137)、1.46%(2/137)和2.19%(3/137),差异均无统计学意义(P值均>0.05);以表型药敏结果为金标准,tNGS法检测利福平、异烟肼、链霉素、乙胺丁醇、对氨基水杨酸、氟喹诺酮类、卡那霉素、卷曲霉素的敏感度分别为95.97%、87.37%、71.70%、74.47%、0、82.76%、50.00%及100%;特异度分别为92.31%、97.62%、97.62%、91.11%、100%、97.22%、100%及99.26%;准确度分别为95.62%、90.51%、87.59%、85.40%、99.27%、94.16%、97.81%及99.27%;Kappa值分别为0.776、0.792、0.726、0.669、-、0.821、0.657及0.796;AUC值分别0.941、0.925、0.8470、0.828、0.500、0.901、0.750、0.996。结论:tNGS法可以直接从临床标本中快速准确地检测结核分枝杆菌,预测利福平、异烟肼、氟喹诺酮类、卷曲霉素、链霉素、乙胺丁醇、卡那霉素和对氨基水杨酸等抗结核药物耐药性的准确度达到85%以上,对利福平、异烟肼、氟喹诺酮类药物、卷曲霉素的耐药性诊断有较好的应用价值。

    Abstract:

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文
相关视频

分享
文章指标
  • 点击次数:
  • 下载次数:
  • HTML阅读次数:
  • 引用次数:
历史
  • 收稿日期:2024-07-28
  • 最后修改日期:2024-11-15
  • 录用日期:2024-11-15
  • 在线发布日期:
  • 出版日期:
文章二维码