鼻咽癌与重度抑郁症的生物标记物研究
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1.广西医科大学;2.广西医科大学护理学院

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国家自然科学基金项目(面上项目,重点项目,重大项目),广西学生资助研究专项立项课题


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    目的 本研究旨在通过生物信息学分析鼻咽癌(Nasopharyngeal Carcinoma,NPC)患者与重度抑郁症(major depressive disorder,MDD)患者的共同生物标记物,筛选并鉴定他们共同相关的枢纽基因和生物学通路。方法 在这项研究中,我们使用r语言分析了GSE12452、GSE98793数据集中NPC、MDD与正常人群之间的差异表达基因。接着,我们使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)进行取交集来筛选高度相关的基因。然后,我们基于Cox回归筛选核心基因,LASSO回归构建预后风险模型并绘制受试者工作特征(ROC)曲线。该模型使用来自基因表达综合(GEO)的外部数据集进行了验证。结果 我们的结果显示,3个基因(CKAP5、GRB10、TPT1)被鉴定为NPC和MDD的核心基因。根据中位风险评分可将NPC患者分为高风险组和低风险组,低风险组患者生存时间延长,免疫浸润增强,而且浸润免疫细胞与预后基因和风险评分有很强的相关性。此外,使用数据集GSE102349验证了NPC预后风险模型有效预测总生存期。

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  • 收稿日期:2025-01-13
  • 最后修改日期:2025-02-05
  • 录用日期:2025-02-10
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