鼻咽癌与重度抑郁症的生物标记物研究
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R739.63

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    目的 本研究旨在通过生物信息学分析鼻咽癌(NPC)患者与重度抑郁症(MDD)患者的共同生物标记物,筛选 并鉴定他们共同相关的枢纽基因和生物学通路。方法 本研究使用R 语言分析了GSE12452、GSE98793数据集中 NPC、MDD与正常人群之间的差异表达基因。使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)进行取交集来筛选高度相关的 基因。基于Cox回归筛选核心基因,LASSO 回归构建预后风险模型并绘制受试者工作特征(ROC)曲线。该模型使用来 自基因表达综合(GEO)的外部数据集进行了验证。结果 结果显示3个基因(CKAP5、GRB10、TPT1)被鉴定为NPC 和MDD的核心基因。根据中位风险评分可将NPC患者分为高风险组和低风险组,低风险组患者生存时间延长,免疫 浸润增强,而且浸润免疫细胞与预后基因和风险评分有很强的相关性。此外,使用数据集GSE102349验证了NPC预后 风险模型有效预测总生存期。结论 本研究通过生物信息学分析鉴定了NPC与MDD相关联的3个预后能力最强的核 心基因CKAP5、GRB10和TPT1,并发现他们对NPC的预后有影响。

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