综合转录组分析鉴定弱精子症与1型糖尿病的共同枢纽基因及通路研究
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广西医科大学第一附属医院

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广西自然科学“KLK3基因功能性SNPs与精液精液液化异常易感性的关联分析及生物学效应研究”(编号:2018GXNSFAA050115)。


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    目的 通过生物信息学研究探索弱精子症(Asthenozoospermia,AZS)与1型糖尿病(Type 1 diabetes mellitus,T1DM)的共病基因,寻找AZS和T1DM的诊断和预后相关分子标志物。 方法 从GEO数据库获取AZS数据集GSE160749和T1DM数据集GSE154609,利用R语言limma包筛选差异表达基因(DEGs),通过基因集富集分析(GSEA)和基因本体(GO)富集分析解析差异表达基因的通路特征,采用GeneMANIA网络分析构建差异表达基因相互作用网络,应用最小绝对收缩算法(LASSO)筛选关键基因,并通过受试者工作特征(ROC)曲线评估其诊断效能,应用CIBERSORT算法分析共病关键基因与免疫细胞浸润的关联。结果 在AZS数据集中共筛选出661个DEGs,其中包括上调154个和下调507个。在T1DM数据集中共筛选出233个DEGs,包括上调153个和下调80个。GSEA显示在GSE160749数据集中,基因主要富集在OLFACTORY等信号通路,在GSE154609数据集中,基因主要富集在C4和C2激活因子的产生等信号通路。GO分析结果显示DEGs在补体经典激活途径等生物学过程中显著富集。基于GeneMANIA构建的蛋白互作网络,鉴定出C3、CFB等24个核心互作基因。LASSO回归确认SCGB1C1和IGHG3为候选枢纽基因。SCGB1C1和IGHG3在AZS中的ROC曲线下面积(Area Under Curve,AUC)分别为0.933和0.833,在T1DM中为0.715和0.701。免疫浸润分析表明,SCGB1C1和IGHG3可能与免疫T细胞、免疫微环境的改变相关。结论 SCGB1C1和IGHG3可能通过调控免疫代谢失衡参与AZS与T1DM的共病机制,在AZS中初步展现出诊断潜力,在T1DM中的诊断价值尚需进一步验证。

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  • 收稿日期:2025-11-19
  • 最后修改日期:2025-12-23
  • 录用日期:2025-12-25
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