整合基因组与转录组的AMT基因泛癌生物信息学分析
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R730.5

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    目的 通过泛癌分析系统揭示氨基甲基转移酶(aminomethyltransferase,AMT)基因在肿瘤发生发展中的作用, 评估其作为肿瘤诊疗中新型分子生物标志物的潜力。方法 基于TCGA、GTEx等公共数据库,整合多组学数据,采用 孟德尔随机化分析、差异表达分析、生存分析、功能富集、免疫微环境评估及药物敏感性预测等方法,系统研究AMT 在 33种肿瘤中的表达模式、突变特征、临床相关性及其与肿瘤突变负荷(tumormutationburden,TMB)、微卫星不稳定性 (microsatelliteinstability,MSI)和免疫浸润的关联。结果 AMT 在13种肿瘤中低表达,其高表达与肾透明细胞癌 (KIRC)等患者的总生存期延长相关(P <0.05),且表达水平与肿瘤分期、年龄及性别等临床特征相关(P <0.05)。分 子机制上,AMT表达与TMB、MSI评分呈癌种特异性关联。免疫微环境分析揭示AMT高表达与活化的免疫细胞负相 关,而与静息态免疫细胞正相关。功能富集表明AMT参与细胞周期调控、代谢重编程和DNA 损伤修复通路。药物敏 感性分析筛选出12种与AMT表达正相关的治疗药物(P <0.05),并预测氯米芬等4种潜在靶向药物。突变谱分析显 示AMT在泛癌中以错义突变为主,主要富集于GCV_T结构域。蛋白质互作网络发现AMT与叶酸代谢酶(MTHFD2、 SHMT2)密切关联,且共表达基因NICN1在10种肿瘤中具有预后价值。结论 AMT在泛癌中具有显著的表达特征与 临床预后相关性,具备作为预后标志物和潜在治疗靶点的价值,为癌症精准诊疗提供新策略。

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